(1)真菌病害 真菌性病害是花卉病害中最主要的一类。真菌是没有叶绿素的低等植物，肉眼看不见。它不能自造养分，以菌丝体在花卉体内吸收养料。真菌孢子借风、雨、昆虫等四处传播。常见花卉真菌性病害有： 
     白粉病：病菌附生在芽蕾和嫩叶上，出现白色霉层，被害叶和梢卷曲萎缩、畸形，花蕾不能正常开放，病菌孢子随气流传播蔓延，昼夜温差在10℃时最易大面积发作，温室内最易蔓延。如月季、倒挂金钟、梅花、凤仙花、瓜叶菊、大丽花白粉病等。 
     黑斑病：为花卉常见病害，病菌在土壤中潜伏，随雨水溅落侵人下部叶片，迅速向上蔓延。被害叶片先出现黑色斑点，逐渐扩大成圆形、椭圆形接连成片。病叶萎黄、凋落，对花卉生长影响大。通常在7—8月雨季发病较迅猛。常见的有月季、菊花、牡丹、天竺葵黑斑病等。 
     黑锈病：病菌孢子侵染，开始叶片正面出现苍白色小斑点，逐渐膨大呈稍圆形突起，背面表皮破裂生出橙黄色粉末，随风飞散，大面积侵染。随后，在叶片上生暗墨色椭圆斑点，叶背表皮破裂后，又生出黑色粉末。严重时，自下而上全株染病，叶片焦枯，提早脱落。常见的有玫瑰、鸢尾、蔷薇黑锈病等。 
     幼苗立枯病：由镰刀菌、丝核菌和腐霉菌引起的幼苗病害，表现症状为腐烂、淬倒、立枯等，以幼苗出土20天内受害最重。常见的有唐葛蒲、百合、海棠、香石竹立枯病等。 
     炭疽病：主要为害叶片，也可为害茎部。一种是在叶片上，长出淡褐色或灰白色而边缘则呈紫褐色或暗褐色的近圆形斑点。此斑点常发生于叶缘或叶尖，其上有黑色小点，即病菌分生孢子盘。严重时使大半叶片枯黑。如兰草炭疽病，也常见于白兰、橡皮树、仙客来、绣球等花卉上；另一种是在茎上产生圆形或近圆形的病斑，呈淡褐色，其上生黑色小点。如仙人掌类炭疽病，霉雨季节或秋雨连绵时，为害严重。防治法：平日要注意盆花的透光和通风，不要放置过密。少量叶片受害时，可剪除病叶烧毁，严重时可喷射50％多菌灵可湿性粉剂500一1000倍溶液，或50％托布津可湿性粉剂500倍溶液，有较好的防治效果。 
     煤烟病：为害多种花木的枝叶和果实。病原为多种真菌。它们多以蚜虫或介壳虫作为传播的媒介。初期叶表面出现暗褐色霉斑，逐渐扩大形成黑色煤烟状霉层，阻碍植株的光合作用，使植株无法制造养分而枯萎死亡。防治法：应首先防治蚜虫和介壳虫；如已发生煤烟病，夏季可用波美0．3度石硫合剂，冬季用3度、春季用1度的石硫合剂防治；也可用上例中的多菌灵、托布津防治。 
     此外，还有根腐病、叶斑病等。 
     (2)细菌病害 细菌是一种很小的单细胞生物，没有营养体和繁殖体的分化，通过细脑膜摄取养分，以分裂方式进行繁殖。细菌侵染主要通过气孔、蜜腺、伤口等途径，一般借流水、风雨、昆虫、土壤以及病株残余体等来传播。常见的细菌病害有月季、榆叶梅的根癌病和柑梅的溃疡病等。 
     (3)病毒病害 病毒是一种极微小的寄生物，用电子显微镜才能看见，病毒只在活的花卉细胞内繁殖。病毒通过昆虫(主要是刺吸式口器昆虫，如蚜虫、红蜘蛛等)、嫁接、机械损伤等途径传播。病状有花叶、黄化、卷叶、畸形、丛矮、坏死、斑点等。常见的有月季、海棠的花叶病和锈果病等。